@tka2kiによる生物系研究者向けオープンソースソフトウェアまとめ

tka2ki @tka2ki

OsiriXは、オザイリクスって読むのか。お尻エックスと読んでいた。 http://bit.ly/c6oxgu

tka2ki @tka2ki

OsiriXはこれほど高度な機能を持っていながら無料で使える。open sourceという仕組みは本当にありがたい。

tka2ki @tka2ki

最近は、その他にも強力なopen sourceソフトが数多くある。生物系の研究者だったら、ほとんどソフトウェアにお金をかけずに仕事ができるくらいかもしれない。

tka2ki @tka2ki

MSオフィスはOpenOfficeで代用できる。

tka2ki @tka2ki

Adobe IllustratorとPhotoshopはInkscepeとGIMPでＯＫ。http://bit.ly/cx0YBS http://bit.ly/deWx4W

tka2ki @tka2ki

SAS等の統計ソフトはRで行ける。http://bit.ly/dewT63

tka2ki @tka2ki

DNAやタンパク質の配列解析に使われるgenetyxはBioEditで問題ない。http://bit.ly/9XnhsG

tka2ki @tka2ki

文献管理ソフトのEndnoteはZoteroだな。 http://bit.ly/9wcAFe

tka2ki @tka2ki

これだけでもいくらの節約になるんだろう。アカデミックバージョンだとして、４万＋３万＋１０万＋４０万＋５万＝６２万？

tka2ki @tka2ki

研究者一人当たりこれだけ節約できるとすると、日本全体ではいくらの節約だ？生物系に何人の研究者がいるか知らないが、分子生物学会の会員だけで１万人以上いるから、皆がオープンソースで行けば、６２億円の税金が節約できるのか。

tka2ki @tka2ki

officeとadobeを使っている研究者人口はどれくらいだろう。10万人は下らないかな？これだけでも数１０億は軽く削減できそう。

tka2ki @tka2ki

でも、研究費の申請書がOfficeのフォーマットで与えられていたりする。OpenOfficeとの互換性は完璧じゃないから、表が崩れたりする。というわけで、どうしてもOfficeも購入しないといけない。

tka2ki @tka2ki

税金の節約という意味では、官公庁はなるべくProprietaryなソフトに依存しない（要求しない）方がいいと思うのだが。

tka2ki @tka2ki

しかしMatlabの値段の高さは何とかならんのかな。数値計算はRとかScilabで十分だが、機器の制御とかになるとよい代替ソフトを知らない。

tka2ki @tka2ki

RやScilabにData Acquisition toolbox等が装備されることを期待。

tka2ki @tka2ki

以下、オープンソースソフトウェアに感謝でした。

k @kiryu_lvrp

個人的に非常にお世話になっているのがImage J。プラグイン・マクロが豊富で使い勝手もよい。http://rsbweb.nih.gov/ij/ RT @tka2kiによる生物系研究者向けオープンソースソフトウェアまとめ http://togetter.com/li/58359

名状しがたいペンギンのようなものだったも @h_memeo

[科学][研究]みんな大好きImageJ / Togetter - 「@tka2kiによる生物系研究者向けオープンソースソフトウェアまとめ」 http://htn.to/oD2LBp